青霉素是兽医临床上给畜禽治宁疾病的常用药。但是，往往因使用不够合理而导致各种不良后果，不仅给养殖户增加成本，还会造成无谓的经济损失。因此，必须对症用药，合理使用，才能发挥药物作用。
对症用药要合理青霉素是广普抗生素，只对多数革兰氏阳性菌、部分革兰氏阳性球菌、螺旋体、放线菌等具有强大的作用，对革兰氏阳性菌如大肠杆菌、沙门氏菌等作用较弱，对结核杆菌、病毒等无效，对耐药的葡萄菌也无效。因此，如果连续使用3天仍无效果，需要考虑换药。
间隔用药要合理青霉素在生物体内经过3~4小时有90%已排泄，6小时血药浓度明显降低。所以，青霉素在临床治疗中要连续使用3~5天，每天最少要使用2-3次，在症状消失后还需要用药1-2天以巩固治疗。
联合用药要合理一是青霉素与氨基糖菌类抗生素可协同作用，如链霉素、庆大霉素等；二是青霉素与丙磺舒、水杨酸类有协同作用；三是青霉素在中性溶液中较为稳定，在临床应用时最好用注射用水或生理盐水溶液，必须现用现配，绝对不能与维生素C、维生素B、碳酸氢钠、阿托品等混合使用，以免产生混浊，降低效价。
用药途径要合理青霉素钾不耐酸，内服会被胃酸消化酶破坏，不宜内服。还因其水溶液极不稳定，放置时间越长分解越多，因此，用药后不宜饮水。
