食草家畜口服土霉素后，可引起两方面的危害。
一、引起消化道机能和形态的改变。成年食食家畜以草料为主食，消化草料除了依靠消化液外，还要依靠胃肠中大量的微生物。口服土霉素后，胃肠中的微生物受到抑制或被杀死，即打乱正常的消化过程而发生消化紊乱。如羊口服土霉素后，可引起厌食、腹胀、前胃弛缓和腹泻；家兔口服土霉素后，可引起肠黏膜坏死，肠上皮细胞脱落，肠黏膜下层充血和水肿。
二、使家畜发生“二重感染”，引起中毒而死亡。“二重感染”又叫“菌群交替症”。动物肌体内存在着一定数量的细菌，其中有非致病菌，也有致病菌和条件致病菌。由于菌群之间存在着互相制约作用，在一般情况下，彼此之间可以和平共处，维持平衡共生状态。口服土霉素后，敏感菌群受到抑制，耐药菌群即因失去制约而趁机过度繁殖，对肌体造成严重的危害，这就叫作“二重感染”。如某农场的技术人员给成年牛、驴、骡治疗胃肠卡他性炎症时，牛与骡每头口服12克土霉素，驴每头口服8克。共治疗牛9头、骡8头、驴2头。服药后引起“二重感染”，先后发生中毒，经多方抢救，只救活一部分，共死亡牛2头、骡4头、驴1头。“二重感染”的病原菌，主要为金黄色葡萄球菌、真菌和肠道革兰氏阴性杆菌。它们可引起肠炎、肺炎、尿路感染和败血症。此外，肠道内有许多细菌，具有合成B族维生素和维生素K的能力，可供给肌体维生素，对肌体有益，这类细菌受到抑制，则会引起维生素缺乏症
